Des centaines de milliers de génomes viraux ont été analysés à travers le monde
Une nouvelle variante «double mutant» du coronavirus a été détectée à partir d'échantillons collectés en Inde.
Les scientifiques vérifient si la variante, où deux mutations se rencontrent dans le même virus, peut être plus infectieuse ou moins affectée par les vaccins.
Qu'est-ce qu'une variante "double mutant"?
Comme tous les virus, le coronavirus ne cesse de changer de petites manières lorsqu'il passe d'une personne à une autre.
La grande majorité de ces mutations sont sans conséquence et n'altèrent pas le comportement du virus.
Mais certaines mutations déclenchent des changements dans la protéine de pointe que le virus utilise pour s'accrocher et pénétrer dans les cellules humaines - ces variantes pourraient potentiellement être plus infectieuses, provoquer une maladie plus grave ou échapper aux vaccins.
Les vaccins contre les agents pathogènes respiratoires comme le SRAS-Cov2, le virus qui cause Covid-19, nous protègent en stimulant notre corps à fabriquer des anticorps.
Le meilleur type pour nous protéger sont les "anticorps neutralisants" car ils empêchent le virus de pénétrer dans les cellules humaines.
Les experts disent que l'adhésion aux protocoles Covid-19 est importante si nous voulons lutter contre la deuxième vague
Les scientifiques indiens du génome ont détecté une soi-disant «double variante» du nouveau coronavirus.
Le gouvernement a déclaré qu'une analyse des échantillons prélevés dans l'état occidental du Maharashtra a montré "une augmentation de la fraction d'échantillons avec les mutations E484Q et L452R" par rapport à décembre de l'année dernière.
"Tel [double] les mutations confèrent une évasion immunitaire et une infectivité accrue », a déclaré le ministère de la Santé dans un communiqué.
Le Dr Jeremy Kamil, virologue au Louisiana State University Health Sciences Center Shreveport, affirme que le E484Q est similaire à E484K - une mutation observée dans les variantes B.1.351 (Afrique du Sud) et P.1 (Brésil), qui sont apparues indépendamment plusieurs fois..
Si suffisamment de mutations se produisent dans un arbre généalogique viral ou une lignée, le virus peut commencer à fonctionner différemment et la lignée peut devenir une soi-disant «variante préoccupante».
En ce qui concerne la mutation L452R - également trouvée dans la "double mutation" en Inde - elle a d'abord attiré l'attention dans le cadre de la lignée B.1.427 / B.1.429 aux États-Unis, parfois appelée la "variante californienne", a déclaré le Dr Kamil. moi.
L'histoire continue
Ces «doubles mutants» sont-ils rares?
Pas du tout, dit le Dr Kamil, qui a récemment co-écrit une étude sur sept lignées croissantes du nouveau coronavirus aux États-Unis.
"Il est maintenant extrêmement courant de voir plus d'une mutation à la fois - même si nous nous limitons au gène de pointe."
L'Inde a signalé 47262 cas et 275 décès mercredi
Plus tôt dans la pandémie, la plupart des gènes de pointe n'avaient qu'une seule mutation - D614G. Maintenant que la mutation est dominante et partout, "nous en voyons d'autres par-dessus", selon le Dr Kamil.
En fait, GISAID, une base de données de partage ouverte, répertorie 43 virus qui ont à la fois les mutations E484Q et L452R trouvées en Inde.
Le Dr Kamil dit qu'un virus collecté en mars au Royaume-Uni a neuf mutations de pointe. "C'est beaucoup de mutations. Sommes-nous sûrs que la variante indienne n'a que deux mutations en pointe?", Demande-t-il.
Une fois que les chercheurs indiens auront téléchargé leurs données sur le GISAID, des scientifiques du monde entier pourront déterminer si le «double mutant» est de la même lignée que celui trouvé au Royaume-Uni, ou si cette combinaison de mutations est apparue indépendamment, comme ce fut le cas. cas pour les trifecta K417N / T, E484K et N501Y de mutations qui se sont réunies au Brésil et en Afrique du Sud pour donner naissance à leurs souches, P.1 et B.1.351.
Dans quelle mesure devrions-nous nous inquiéter de la nouvelle variante?
Des mutations dans le gène de pointe peuvent rendre le virus intrinsèquement «meilleur» pour infecter les gens ou peuvent aider le virus à échapper aux anticorps neutralisants.
Cela signifie que si le virus mute de la «bonne manière», il peut réinfecter quelqu'un qui a déjà récupéré de Covid-19.
Mais les scientifiques affirment que les réinfections seront très bénignes par rapport aux infections primaires chez les personnes vaccinées ou qui se sont déjà remises d'un cas antérieur de Covid-19.
Mais si le virus peut utiliser la réinfection pour se propager, il s'agirait alors d'une immunité collective «pénétrante», dit le Dr Kamil. (L'immunité collective se produit lorsqu'une grande partie d'une communauté devient immunisée contre une maladie par la vaccination ou par la propagation massive de la maladie.)
Cela expose les personnes les plus vulnérables à un risque de maladie grave, car le virus peut se déplacer dans le troupeau pour les atteindre.
Il dit que contrairement à certaines autres variantes, la nouvelle double variante de l'Inde n'est pas susceptible d'être plus mortelle ou plus intrinsèquement transmissible, mais que plus de données sont nécessaires pour en être sûr.
La variante est-elle la raison de la deuxième vague de l'Inde?
L'Inde a signalé 47 262 cas et 275 décès mercredi - la plus forte augmentation quotidienne de cette année.
Le Dr Rakesh Mishra, directeur du Center for Cellular and Molecular Biology (CCMB) basé à Hyderabad, m'a dit que la "double variante" avait été trouvée dans 20% des cas dans le Maharashtra, qui a connu un énorme pic d'infections signalées..
«On soupçonne que cette variante est la cause de la deuxième vague d'infections en Inde. Je dirais que non, 80% des échantillons que nous avons séquencés ne contiennent pas cette combinaison de mutants. Ce mutant a été lié à seulement 230 cas dans le Maharashtra des plusieurs milliers d'échantillons séquencés », a-t-il dit.
Un certain nombre d'États ont signalé une forte hausse des infections
Beaucoup plus inquiétant est le Royaume-Uni ou la variante Kent (également connue sous le nom de B.1.1.7), qui est maintenant dominante dans une grande partie de la Grande-Bretagne et s'est étendue à plus de 50 pays. Un total de 736 des 10 787 échantillons séquencés en Inde ont été trouvés positifs pour cette variante.
Cette variante est plus susceptible de contribuer à une "seconde vague intense", dit le Dr Kamil. (Selon des études, il est plus de 50% plus transmissible et 60% plus mortel - 1,6 décès pour chaque décès causé par la version précédente du virus.)
"Cependant, ce sera surtout le comportement humain qui entraînera une deuxième vague", déclare le Dr Kamil.
