Une nouvelle variante de Covid détectée en Afrique du Sud a fait les gros titres du monde entier.
Lundi, l'Institut national des maladies transmissibles d'Afrique du Sud a émis une alerte sur la «lignée C.1.2», affirmant qu'elle avait été détectée dans toutes les provinces du pays, mais à un taux relativement faible.
C.1.2 a été détecté pour la première fois en mai, selon l'alerte, mais Delta est toujours la variante dominante qui se propage en Afrique du Sud et dans le monde.
Un article préimprimé non évalué par des pairs publié sur la variante a déclaré que C.1.2 "a depuis été détecté dans la majorité des provinces d'Afrique du Sud et dans sept autres pays en Afrique, en Europe, en Asie et en Océanie".
La lignée C.1.2 a attiré l'attention des scientifiques car malgré son faible taux dans la population, elle possède des mutations dans le génome similaires à celles observées dans les variantes d'intérêt et les variantes préoccupantes, comme la variante Delta, ainsi que quelques mutations supplémentaires.
Alors, que savons-nous de la nouvelle variante et à quel point devrions-nous nous en préoccuper ?
L'Organisation mondiale de la santé l'a-t-elle répertoriée comme une variante d'intérêt ou de préoccupation ?
Pas encore. L'Institut national des maladies transmissibles continue de surveiller la fréquence de C.1.2 et d'examiner son comportement. Des tests pour évaluer l'impact des mutations qu'il possède sur l'infectiosité et la résistance vaccinale sont toujours en cours. Jusqu'à présent, le virus n'a pas rempli les critères de l'OMS pour être qualifié de "variante préoccupante" ou de "variante d'intérêt".
Les variantes préoccupantes, telles que Delta, sont celles qui présentent une transmissibilité, une virulence ou une modification de la maladie clinique accrues, et une efficacité réduite des mesures de santé publique et sociales.
Les variantes intéressantes sont celles qui provoquent une transmission communautaire dans plusieurs grappes et qui ont été détectées dans plusieurs pays, mais qui ne se sont pas encore nécessairement avérées plus virulentes ou transmissibles.
Alors pourquoi une alerte a-t-elle été émise ?
Un virologue et conférencier en immunologie et maladies infectieuses à la Central Clinical School de l'Université de Sydney, le Dr Megan Steain, a déclaré que c'était à cause des mutations particulières que C.1.2 contient.
"Il contient un certain nombre de mutations clés que nous voyons dans d'autres variantes qui sont devenues des variantes d'intérêt ou de préoccupation", a déclaré Steain. "Chaque fois que nous voyons ces mutations particulières apparaître, nous aimerions garder un œil sur la variante pour voir ce qu'elle va faire. Ces mutations peuvent affecter des choses comme si elles échappent à la réponse immunitaire ou se transmettent plus rapidement. »
Il faudra un certain temps aux scientifiques pour faire les tests de laboratoire pour voir si le virus est en fait plus en forme, a-t-elle déclaré.
"Bien que nous puissions dire qu'il comporte quelques mutations clés qui ont rendu d'autres variantes plus infectieuses, ce que nous trouvons souvent, ce sont les mutations qui fonctionnent en synergie, ce qui peut globalement conduire à un virus plus apte, potentiellement, ou à un virus plus faible.
« Toutes ces études en laboratoire prennent un certain temps. Il y a beaucoup de travail à faire. »
Y a-t-il une chance que cette variante disparaisse ?
Oui. Les variantes de Covid-19 émergent tout le temps et beaucoup d'entre elles disparaissent avant qu'elles ne deviennent un réel problème. De nombreuses variantes de virus sont très fragiles.
Les mutants clés sont ceux qui survivent aux changements et continuent, et commencent à envahir les variantes du passé, ce que nous avons vu avec Delta.
"C.1.2 devrait être assez bon, assez en forme et assez rapide pour surpasser Delta à ce stade", a déclaré Steain. «Je pense que nous sommes encore à un point où cela pourrait disparaître, la prévalence est vraiment faible.
«Nous avons vu cela avec la variante bêta et d'autres variantes préoccupantes, où il semblait qu'il pourrait y avoir un problème, ils avaient même des zones où ils étaient transmis et se propageaient assez bien. Mais ensuite, ils ne se sont pas vraiment imposés avec le temps et ont été dépassés par d'autres variantes préoccupantes capables de transmettre plus rapidement. Et donc ils meurent essentiellement.
« Cela pourrait facilement encore arriver avec C.1.2. »
Que veulent dire les scientifiques lorsqu'ils parlent d'une variante « plus en forme » ?
En utilisant Delta comme exemple, cela signifie qu'il a acquis des mutations qui lui permettent de se répliquer plus rapidement et d'entrer plus efficacement dans les cellules.
« Nous l'appelons « l'affinité » ; la capacité par laquelle il est capable de s'accrocher et de s'attacher aux récepteurs de la cellule hôte qui permettent aux particules virales d'entrer dans les cellules », a déclaré Steain. «Il est mieux préparé et prêt à l'emploi pour s'accrocher aux cellules et entrer et commencer une infection en premier lieu. Et puis, il semble également se répliquer un peu plus rapidement, ce qui crée plus de particules virales en moins de temps. »
Savons-nous si les vaccins seront efficaces contre C.1.2 ?
"Nous pouvons faire une supposition éclairée sur la base de certaines des mutations qu'il a, en ce sens qu'il est similaire à ce que nous avons vu dans d'autres variantes comme la version bêta, ainsi que Delta", a déclaré Steain.
"Nous pensons donc que le sérum ne neutralisera peut-être pas aussi bien qu'il le ferait contre une souche ancestrale. Mais jusqu'à ce que nous fassions réellement ces expériences, c'est vraiment spéculatif. Nous devons garder à l'esprit que jusqu'à présent, le vaccin semble résister très, très bien en termes de prévention des infections graves, des hospitalisations et des décès dus à des variantes. Ils sont vraiment bons pour empêcher cela.
Elle a dit qu'il n'y avait pas lieu de paniquer.
"Cependant, il est important de garder un œil sur les autres variantes qui existent et de simplement regarder et voir comment elles vont."
L'Institut national sud-africain des maladies transmissibles a déclaré : «Nous sommes prudents quant aux implications, alors que nous recueillons plus de données pour comprendre le virus de cette lignée.
« Sur la base de notre compréhension des mutations de cette variante, nous soupçonnons qu'elle pourrait être en mesure d'échapper partiellement à la réponse immunitaire, mais malgré cela, les vaccins offriront toujours des niveaux élevés de protection contre l'hospitalisation et la mort », a déclaré l'institut.
