Dix-huit mois après le début de la pandémie, la Louisiane et plus de 20 autres États tentent toujours de combler les principales lacunes dans les données tout en combattant la version la plus agressive à ce jour du virus. Avec de nouveaux cas qui continuent de faire boule de neige, la réouverture des écoles et les vacances à venir, les responsables de la santé de l'État se préparent à une chute brutale – et à la possibilité qu'une nouvelle variante encore plus dangereuse émerge dans les mois à venir.
«C'est un peu comme si nous étions de retour au début parce que les cas augmentent si rapidement. les hospitalisations ont augmenté si rapidement … les tests ont augmenté si rapidement », a déclaré Lee Mendoza, directeur de l'informatique de santé au département de la santé de la Louisiane, dans une récente interview. « Les exigences de notre temps, à la fois en termes de demandes de données, d'informations et de rapports supplémentaires, augmentent vraiment à un rythme très difficile. »
Les efforts de recherche des contacts ont diminué en Louisiane et dans tout le pays au cours de la dernière année, en raison d'un écrasement de cas et de pénuries de personnel. Des milliers de laboratoires n'envoient toujours pas les résultats des tests par voie électronique, ce qui ralentit les opérations de surveillance des services de santé - un retard catastrophique face à Delta, qui est deux à trois fois plus contagieux que la version originale du coronavirus.
Les responsables de la santé d'au moins 20 États ont déclaré à POLITICO que leurs systèmes de données et le processus de surveillance patchwork n'allaient jamais résister à Delta.
La Louisiane – qui est maintenant aux prises avec les conséquences de l'ouragan Ida – a mieux géré le déluge de données que la plupart des États. Il s’agit de ressources dédiées à la ventilation des données sur les infections à Covid par race et origine ethnique, ainsi qu’à l’étude des infections révolutionnaires et à la diminution de l’immunité vaccinale. Le département de la santé de l'État a également mis en œuvre des mesures pour aider à rationaliser la collecte de données, l'embauche de fournisseurs et la création de systèmes ad hoc pour combler les lacunes dans les rapports.
Bien que le département de la santé ne puisse toujours pas effectuer de séquençage génomique en interne sur des échantillons de virus, il s'est associé à des établissements universitaires pour augmenter le nombre d'échantillons qu'il envoie pour séquençage chaque mois. En juin, l'État avait séquencé 418 spécimens de Covid-19. À la fin du mois de juillet, ce nombre est passé à 1 672.
Mais la Louisiane ne séquence toujours pas autant d'échantillons qu'elle le souhaite, et cela, avec des problèmes de laboratoire et des erreurs dans les informations d'hospitalisation, a créé des angles morts dans les ensembles de données clés. À cause de cela, et du fait que la plupart des adultes de Louisiane renoncent aux vaccins Covid-19, les responsables de la santé de l'État ont prédit que les cas augmenteraient de manière incontrôlable à mesure que Delta s'installait.
Et ils l'ont fait.
La colère de Delta
Au début du mois de juillet, la Louisiane avait signalé un peu plus de 10 700 décès de Covid-19 et environ 482 000 cas. Environ 30 pour cent de sa population a été vaccinée.
À la fin du mois d'août, 1 550 autres personnes étaient décédées et 194 000 avaient été infectées, selon le CDC. Plus de 14 200 de ces cas faisaient partie des personnes entièrement vaccinées, ont déclaré des responsables de la santé de la Louisiane. Au cours de cette période, environ 500 000 personnes ont reçu la première injection de vaccin.
Ces chiffres reflètent une réalité dont les responsables de la santé publique et les médecins de Louisiane ont du mal à parler. Reconnaître que leurs systèmes de données vacillent, que les enquêtes sur les cas ralentissent et que Delta déferle autour d'eux, c'est admettre qu'ils n'ont pas pu suivre la variante malgré tous leurs efforts.
Interrogés sur leurs efforts pour collecter des données, rationaliser les rapports et analyser les données, les responsables de la santé ont souvent répondu avec un soupir. Le pire, ont-ils dit, est que les pannes dans la collecte et le traitement de ces informations étaient en grande partie évitables.
Les responsables de la santé demandent depuis des années au gouvernement fédéral de consacrer plus de ressources à la reconstruction de l'infrastructure de santé publique en ruine du pays. Les États suivent souvent les maladies de différentes manières, leurs systèmes ne communiquent pas entre eux et ils ne permettent pas toujours aux autorités de charger automatiquement les données sur les cas d'une enquête épidémique à l'autre.
Les avertissements concernant les lacunes dans les données préjudiciables étaient forts et cohérents dans le monde de la santé publique. Mais apparemment, personne au sein du gouvernement fédéral n'a réagi avec urgence, ont déclaré à POLITICO des dizaines de responsables de la santé. Ainsi, lorsque les cas a recommencé à augmenter plus tôt cet été, les responsables de la santé publique de la Louisiane se sont préparés à une autre poussée dévastatrice.
Le département de la santé de l'État était toujours aux prises avec un problème majeur à l'arrivée de Delta : faire en sorte que les laboratoires de tests rapportent les résultats par voie électronique, dans un format que les systèmes du gouvernement de la Louisiane pourraient comprendre et synthétiser.
Le département de la santé a passé des mois à essayer de résoudre le problème, a déclaré Theresa Sokol, épidémiologiste en chef de la Louisiane. Mais au début de l'été, son équipe travaillait toujours avec les laboratoires pour les sevrer en fournissant des résultats par courrier ou par fax – des options qui ont retardé les enquêtes de l'État sur les cas et les épidémies et ont mis le personnel à rude épreuve, a déclaré Sokol.
« Il aurait été bien d'avoir tout en place pour les rapports de laboratoire électroniques qui pourraient accueillir le volume de rapports de laboratoire que nous recevons, et aussi de pouvoir avoir du personnel et être prêt à intégrer le nombre de nouveaux journalistes que nous J'ai vu », a déclaré Sokol. « Il n'y a personne qui s'y soit préparé.
La Louisiane a consacré plus de temps et de ressources à s'assurer que les résultats des tests non électroniques sont arrivés à le département dans les plus brefs délais. Mais cela a obligé les membres du personnel à passer des heures supplémentaires au bureau pour trouver de nouvelles et meilleures façons de s'assurer que les données dont ils disposaient étaient aussi à jour que possible.
"Quand vous regardez la quantité de données que nous devons traiter. c'est comme construire un avion en vol", a déclaré Mendoza.
La confusion monte
Alors que les responsables de la santé en Louisiane cherchaient de meilleurs moyens de contrôler la propagation de Delta et de réduire le nombre de cas en augmentation, les responsables fédéraux de la santé commençaient à peine à comprendre la menace posée par la variante.
Des études en Israël et au Royaume-Uni ont montré que Delta était beaucoup plus transmissible que les versions antérieures du virus et a provoqué une forte augmentation des taux d'hospitalisation dans les communautés sous-vaccinées. Mais à l'époque, les responsables de la santé de l'administration Biden se méfiaient encore de l'exactitude de ces rapports. Ils voulaient étudier Delta au niveau national.
Les responsables du CDC ont appelé le département de la santé de la Louisiane au cours de l'été pour se renseigner sur l'augmentation du nombre de cas. Pour les experts en santé de la Louisiane, il semblait que le gouvernement fédéral ne comprenait pas le danger que représentait Delta. Il n'y avait pas de statistiques nationales fiables pour montrer à quelle vitesse Delta se propageait et où il prédominait. Et le CDC essayait toujours de comprendre avec quelle facilité la variante infectait les personnes, y compris celles qui étaient complètement vaccinées.
Cela a laissé la Louisiane et d'autres États dans le noir, à la recherche de réponses du gouvernement fédéral pour savoir s'ils devraient envisager de recommander des mandats de masque et de fermer ou de limiter certains types d'entreprises.
À la mi-juillet, les camps d'été et les grands rassemblements en salle avaient fait monter en flèche les cas en Louisiane, a déclaré Sokol. Les traceurs de contacts et les enquêtes sur les cas n'ont pas pu suivre. Et les hôpitaux de la Nouvelle-Orléans, de Baton Rouge et de Lafayette ont été débordés par l'afflux constant de patients.
"Tout le monde essayait juste de comprendre", a déclaré un haut responsable de la santé de Biden. « Nous n'avions jamais rien vu de tel que Delta et nous avons dû utiliser de nombreux flux de données différents pour essayer de nous préparer à d'autres surtensions. »
Mais le réseau de signalement des maladies infectieuses du CDC était désordonné – décousu et encombrant. L'agence s'appuie régulièrement sur les services de santé des États pour envoyer des données sur les épidémies, y compris Covid-19. Mais les services de santé des États n'ont pas les ressources ou les systèmes de données en place pour envoyer la qualité du CDC et des données à jour sur les cas et les épidémies.
Et tous les services de santé n'ont pas accès aux dossiers de vaccination de leur État. D'autres ne peuvent pas faire correspondre les registres de vaccination avec les données d'hospitalisation, ce qui limite la capacité du CDC à comprendre toute l'étendue de la manière dont Delta a affecté les personnes vaccinées et non vaccinées.
En juillet, le CDC a demandé aux États d'envoyer les rapports des hôpitaux sur le nombre de cas de Covid qu'ils traitaient. Il a également lancé une étude avec la Louisiane et d'autres États pour étudier toutes les infections révolutionnaires, pas seulement celles qui ont conduit à une hospitalisation. Les résultats sont toujours en attente.
La poussée
Alors que juillet s'étendait jusqu'en août, le nombre d'hospitalisations en Louisiane a de nouveau bondi. Pour les médecins et les responsables de la santé de l'État, il était clair que la variante Delta se transmettait plus facilement que les souches précédentes. Les hôpitaux ont commencé à voir des personnes plus jeunes arriver chercher des soins – un changement par rapport aux poussées passées lorsque les personnes âgées souffrant d'autres problèmes de santé qui augmentaient leur vulnérabilité au virus avaient besoin de l'attention la plus aiguë.
"Il y avait un test visuel si vous attrapez Covid, en regardant un patient diabétique et obèse et ils ont ces facteurs de risque, ils ne vont pas bien faire", a déclaré Tonya Jagneaux, médecin de soins intensifs à Notre-Dame de le Lake Regional Medical Center à Baton Rouge, lors d'une entrevue en juillet. « Maintenant, nous ne pouvons pas dire cela. Je ne peux pas regarder la personne et dire que tu vas mourir ou que tu vas mal faire parce qu'il y a Delta. Et Delta n'est pas seulement contagieux, mais est plus agressif. Et il s'en prend à des personnes qui ne se considéreraient jamais comme une victime potentielle de la maladie. »
Sans opérations rigoureuses de recherche des contacts, il était impossible d'identifier les grappes de transmission et de savoir exactement ce qui rendait les gens plus sensibles à une maladie grave, au-delà de leur statut vaccinal.
La communication entre le gouvernement fédéral et les États avait également diminué, selon des entretiens avec des dizaines de responsables de la santé des États. Les briefings réguliers de l'administration Biden avec les bureaux des gouverneurs sont devenus moins fréquents, et les services de santé ont déclaré qu'ils avaient du mal à atteindre les hauts responsables du CDC, dont beaucoup étaient absorbés par le lancement ou l'analyse de leurs propres études nationales Delta. Plusieurs responsables de la santé de l'État ont déclaré qu'ils n'avaient appris la pensée du CDC sur la variante que par le biais de la presse ou des conférences de presse de la Maison Blanche.
Ce n'est que le 28 juillet que le CDC a publié des données étayant sa recommandation selon laquelle les personnes entièrement vaccinées devraient à nouveau porter des masques à l'intérieur. Les preuves suggèrent que les personnes complètement vaccinées qui sont infectées par Delta portent des niveaux de virus similaires à ceux observés chez les personnes infectées et non vaccinées. Mais les données n'ont pas répondu à une question cruciale : les personnes infectées et vaccinées sans symptômes pourraient transmettre le virus aussi facilement que celles qui présentaient des symptômes.
Au moment où le CDC a annoncé ses nouvelles directives sur les masques, Delta avait envahi de vastes étendues de la Louisiane. De nombreux résidents de l'État n'ont pas adhéré aux recommandations du gouvernement fédéral sur le masquage et la distanciation sociale.
Les médecins de Notre-Dame du Lac étaient étirés. Des dizaines d'infirmières et de médecins ont démissionné au cours de la dernière année, épuisés par le traitement des patients de Covid-19. D'autres étaient partis pour des emplois médicaux itinérants mieux rémunérés. Et la demande de soins poussait à nouveau l'établissement dans ses retranchements.
"Nous avons 68 patients Covid ici aujourd'hui", a déclaré la directrice médicale de l'hôpital, Catherine O'Neal, dans une interview fin juillet. O’Neal a déclaré qu’elle ne dormait que quelques heures et que son mari, également médecin, avait été appelé pour aider à soigner les patients gravement malades de Covid-19 au Lafayette General Medical Center.
Elle et son personnel se démenaient pour trouver des moyens de faire de la place à davantage de patients Covid-19. L'unité de soins intensifs était pleine, tout comme l'hôpital d'en face. Et il n'y avait pas assez de médecins pour soigner les patients qui avaient déjà des lits.
"Ce qui est le plus surprenant, c'est juste le nombre de cas et la vitesse à laquelle ils arrivent", a déclaré O'Neil. « Tout le monde est infecté très rapidement. »
Percées
Alors que les taux de cas continuaient d'augmenter tout au long du mois d'août, les responsables fédéraux de la santé ont insisté sur le fait que le risque d'infection après la vaccination était rare. Encore plus rares, ont-ils dit, étaient des cas qui ont fait atterrir des personnes entièrement vaccinées à l'hôpital.
Mais les responsables de la santé de l'État commençaient à constater une augmentation du nombre d'infections chez les personnes vaccinées. La Louisiane, contrairement à de nombreux autres États, avait la possibilité de faire correspondre le registre de vaccination de l'État avec ses résultats de laboratoire Covid-19. Son service de santé a dédié une équipe au suivi des infections à percées.
Mais cette équipe n'avait pas la possibilité de faire correspondre les résultats de laboratoire avec les données d'hospitalisation, ce qui révélerait combien de personnes vaccinées avec Covid-19 nécessitaient ce niveau de soins. Au lieu de cela, les responsables de la santé se sont appuyés sur les hôpitaux pour signaler les infections révolutionnaires à l'État. Et les informations qui arrivaient étaient souvent obsolètes et incomplètes.
Les hôpitaux locaux comme Notre-Dame du Lac s'efforçaient d'obtenir des données en temps réel sur lesquelles les patients étaient entièrement vaccinés et infectés lors de leur admission. L'hôpital utilise le système médical EPIC, une plate-forme électronique sur laquelle des milliers de réseaux de soins de santé à travers le pays s'appuient pour numériser les dossiers. Mais EPIC n'avait pas de fonction permettant aux médecins de suivre facilement les infections à percée.
« EPIC n'avait pas forcément de solution tout de suite. Une partie était manuelle au début », a déclaré O'Neal. «Nous effectuons la saisie manuelle via notre service de contrôle et de prévention des infections qui examine de toute façon chaque cas. Nous avons ajouté cela à leur liste de choses à faire.
Malgré les données hospitalières inégales à travers le pays, le CDC avait décidé en mai de ne suivre que les infections révolutionnaires qui ont entraîné une hospitalisation. À l'époque, l'agence avait déclaré qu'elle souhaitait étudier les cas les plus graves pour mieux comprendre si et comment l'efficacité du vaccin voulait des heures supplémentaires.
En août, la Louisiane avait enregistré 14 000 infections de pointe. Mais le CDC, avec son suivi plus étroit, n'a compté que 8 000 cas de percée hospitalisés à l'échelle nationale.
L'agence examine toujours les données du sous-ensemble d'États participant à son étude sur toutes les infections révolutionnaires, pas seulement celles qui ont été hospitalisées. Les résultats pourraient aider les États à mieux comprendre s'ils doivent modifier leurs politiques sur des questions telles que les masques et la distanciation sociale pour protéger leurs résidents dans les mois à venir.
En attendant, Sokol a déclaré que son équipe faisait de son mieux pour trouver de nouvelles façons d'améliorer ses efforts de collecte de données avec les enfants de retour à l'école, la réouverture de plus de bureaux et la possibilité que de nouvelles variantes dangereuses émergent.
Alors que le CDC a commencé à distribuer des millions de dollars pour aider les États à améliorer leur personnel et leur collecte de données, les responsables de la santé en Louisiane et ailleurs disent que les améliorations nécessitent plus d'argent et prendront des années à mettre en œuvre.
Pour l'instant, les responsables de la santé de la Louisiane se consacrent à tenir les résidents de l'État informés de tout changement important dans le comportement du coronavirus. Mais eux et d'autres États sont limités par de profondes failles dans l'infrastructure de santé publique du pays qui rendent difficile, voire impossible, la collecte de données Covid-19 précises et fiables.
"Nous savons à quel point il est important d'avoir les bonnes informations et de pouvoir le faire le plus rapidement possible", a déclaré Mendoza. « Mais il y aura toujours un compromis entre la rapidité avec laquelle nous pouvons signaler et l'exactitude des informations que nous rapportons. »
CORRECTION : Une version antérieure de ce rapport déformait le nombre de personnes infectées par Covid en Louisiane à la fin du mois d'août. C'était 194 000.
