Admise à l'hôpital avec Covid-19, elle avait besoin d'un peu d'oxygène et a reçu des stéroïdes, mais était assez bien pour rentrer chez elle après neuf jours.

Mais le virus est resté dans son corps pendant sept mois, mutant plusieurs fois alors qu'il luttait avec son système immunitaire moins que stellaire.

D'où viennent les variantes du coronavirus ?

C’est ainsi que surgissent les variantes du coronavirus.

Tous les virus mutent constamment si et quand ils se répliquent dans un corps hôte. Plus il y a de personnes infectées, plus le virus a de chances d'évoluer par le processus connu sous le nom de mutation.

"Plus quelqu'un a ce virus, et plus ce virus doit faire face aux réponses des anticorps des gens, plus il y a de chances que des variantes émergent", a déclaré Penny Moore, experte en virus à l'Institut national sud-africain des maladies transmissibles.

Dans ce cas, le patient, un Sud-Africain, était infecté par le VIH, le virus de l'immunodéficience humaine qui cause le SIDA. Son VIH n'était pas bien contrôlé et avait endommagé son système immunitaire, donnant au virus l'avantage dont il avait besoin pour survivre dans son corps pendant plus de 200 jours.

Dans d'autres cas, les personnes peuvent prendre des médicaments immunosuppresseurs parce qu'elles ont subi des greffes d'organes ou pour lutter contre des maladies auto-immunes. Ou ils peuvent simplement avoir un système immunitaire qui est lent à réagir à l'infection.

Mais partout dans le monde, chaque jour, le virus infecte les gens et mute dans leur corps. Lorsque ces mutations donnent au virus une sorte d'avantage – la capacité de se répliquer plus rapidement ou de se cacher du système immunitaire – cette version surpassera les autres.

"Plus quelqu'un a ce virus, et plus ce virus doit faire face aux réponses des anticorps des gens, plus il y a de chances que des variantes émergent", a déclaré Moore lors d'un webinaire organisé plus tôt ce mois-ci par l'International Antiviral Society.

C'est pourquoi les responsables de la santé publique du monde entier demandent à tout le monde de se faire vacciner complètement le plus rapidement possible. Les personnes qui ne sont pas infectées ne font pas cuire un virus en constante évolution dans leur corps.

"C'est la seule façon pour nous de pouvoir nous débarrasser des variantes, c'est de réduire le nombre d'infections", a déclaré Moore.

Et les preuves indiquent que les vaccins actuels utilisés aux États-Unis et dans de nombreux autres pays fonctionnent bien pour protéger les gens contre l'infection en premier lieu.

Jade Fulce.

Le patient sud-africain n'avait pas encore été vacciné. Elle a été infectée en septembre 2020, des mois avant que les vaccins ne soient disponibles.

Elle s'est portée volontaire pour un essai clinique, de sorte que l'équipe de l'Université du KwaZulu-Natal a pu prélever régulièrement des échantillons de son sang et des échantillons de virus pour voir ce qui se passait dans son corps.

Elle a été infectée par la première variante reconnue du coronavirus à balayer le monde, un appelé D614G. Au sixième jour de son traitement, le virus dans son corps avait acquis une autre mutation, appelée E484K. C'est inquiétant car cela aide le virus à échapper à la réponse immunitaire humaine.

"Au jour 190, il y a eu l'émergence de D427Y et N501Y", ont écrit Tulio de Oliveira et ses collègues de l'Université du KwaZulu-Natal en Afrique du Sud dans un rapport pré-imprimé publié en ligne.La mutation N501Y rend un virus plus contagieux.

"Tous les virus ont un récepteur qui leur permet de s'accrocher à une cellule, et c'est le début du processus d'infection", a expliqué Moore. "Et dans certains cas, la capacité de ce virus à se lier au récepteur de la cellule hôte change vraiment la donne pour ce virus", a-t-elle ajouté.

"Un virus qui a un avantage en termes de liaison. cela signifie simplement qu'il a une bien meilleure chance d'infecter les cellules."

Ainsi, les virus porteurs d'une telle mutation auraient plus de succès et seraient plus susceptibles de se répliquer et de se propager que les virus sans la mutation.

"Une grande partie de ce que nous voyons maintenant avec les variantes, c'est cela", a déclaré Moore.

Il existe d'autres mutations plus préoccupantes.

"Un autre est la capacité de devenir un peu plus invisible pour le système immunitaire humain. Lorsque nous parlons d'évasion immunitaire ou de mutations d'échappement d'anticorps, c'est ce que nous voulons dire", a déclaré Moore.

"Le virus a changé de pelage grâce à l'incorporation de l'une de ces mutations pour se permettre de devenir un peu moins visible. C'est comme s'il se cachait sous un parapluie du système immunitaire parce qu'il a réussi à muter son pelage d'une manière ou d'une autre. "

Le variant du virus B.1.351 vu pour la première fois en Afrique du Sud et maintenant appelé variant bêta porte à la fois les mutations E484K et N501Y. Il en va de même pour le P.1. variante, vue pour la première fois au Brésil et également connue sous le nom de Gamma. Cela signifie qu'ils peuvent se répliquer plus facilement et également échapper aux effets de la réponse immunitaire humaine, ainsi qu'aux traitements par anticorps monoclonaux et, dans une certaine mesure, aux vaccins.

"La capacité de se cacher du système immunitaire est ce qui nous fait vraiment peur à propos de ces variantes", a déclaré Moore.

La variante B.1.1.7 ou Alpha vue pour la première fois en Grande-Bretagne a la mutation N501Y mais pas, généralement, E484K.

Ainsi, chez un seul patient, tous ces changements se sont produits alors que le virus avait une longueur d'avance sur son système immunitaire.

"Malgré une courte maladie clinique de gravité modérée, la positivité du SRAS-CoV-2 PCR a persisté jusqu'à 216 jours. Nous démontrons des changements importants dans la population virale au cours de cette période, impliquant de multiples mutations", ont écrit de Oliveira et ses collègues.

Cela ne signifie pas que le seul patient était la source de la variante bêta, ou la source d'une propagation de variante du tout. Ces mutations surviennent chez plusieurs patients dans plusieurs endroits du monde, tous en même temps.

expert en maladies infectieuses au St. Jude Children's Research Hospital de Memphis.

La réponse immunitaire normale à l'infection à coronavirus est immédiate et écrasante.

"C'est là que la pression s'exerce sur ce virus. Il ne mute pas pour le plaisir. Il le modifie pour s'éloigner de cette réponse immunitaire très robuste", a déclaré Moore.

Cela vaut encore plus pour les personnes complètement vaccinées. De nombreuses études ont montré que certains vaccins, en particulier les vaccins à ARNm fabriqués par Pfizer/BioNTech et Moderna, et dans une moindre mesure le vaccin Johnson & Johnson, provoquent une large réponse immunitaire – beaucoup plus large et plus forte que la réponse qui suit une infection naturelle.

"Ils déclenchent des quantités massives d'anticorps. Et cela signifie que même s'ils frappent ce virus avec son parapluie, il y a encore suffisamment d'activité de ces vaccins pour pouvoir faire face à la variante – nous pensons", a déclaré Moore.

« Donc, la puissance est reine en matière de vaccins. »

Les personnes qui n'ont jamais été vaccinées, ou qui n'ont été que partiellement vaccinées, sont plus susceptibles d'être infectées, en particulier avec une variante qui peut déjà échapper en partie à la réponse immunitaire. Les données des Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis montrent que 10 % ou plus des Américains qui ont reçu une dose de vaccin Moderna ou Pfizer ont manqué la deuxième dose.

"S'il vous plaît", a déclaré la directrice du CDC, le Dr Rochelle Walensky à NPR vendredi, "obtenez votre deuxième coup."