Le Minnesota a intensifié son séquençage génomique des échantillons de patients COVID-19 pour identifier plus rapidement les variantes virales émergentes dans le cadre des plans de l'État visant à éliminer progressivement ses restrictions pandémiques, y compris le mandat du masque d'intérieur.
Alors que le gouverneur Tim Walz doit annoncer jeudi un plan en trois phases pour éliminer les restrictions commerciales et sociales en raison de l'amélioration du nombre de cas, les responsables de la santé de l'État ont déclaré qu'une surveillance étroite des variantes plus infectieuses du virus à l'origine du COVID-19 était nécessaire pour prévenir tout résurgence de l'activité pandémique. La variante B.1.1.7 trouvée en Angleterre a largement causé la dernière vague d'infections au Minnesota.
B.1.1.7 a pris une longueur d'avance lorsqu'il a fait surface au Minnesota en janvier, car les activités de séquençage pour l'identifier étaient limitées et la campagne de vaccination COVID-19 de l'État ne faisait que commencer, a déclaré Kris Ehresmann, directeur des maladies infectieuses de l'État. La variante la plus contagieuse s'est d'abord répandue en petits groupes, y compris dans les activités sportives pour les jeunes centrées dans la banlieue du comté de Carver, mais représente maintenant 68% de toutes les nouvelles infections dans le Minnesota.
"Dans cette course, la variante a gagné", a déclaré Ehresmann. "Bien que nous ayons réussi à éviter une forte augmentation due à l'expansion de la vaccination en février, mars et avril - ce qui était des points pour notre équipe. Nous espérons qu'avec la vaccination accrue que nous avons vue… que nous gagnerons de futures courses avec des variantes. "
Le plan de Walz est d'éliminer progressivement les stratégies d'atténuation restantes du COVID-19, y compris le mandat de masque pour les espaces publics intérieurs, qui sera quelque peu lié à la capacité du Minnesota à passer d'un taux de vaccination de 59% parmi les personnes éligibles à 70%.
Le plan fait suite à une semaine de réunions pour Walz avec des chefs d'entreprise et de la santé, ainsi que des législateurs républicains qui souhaitaient que le gouverneur réduise les restrictions de COVID-19 et les pouvoirs d'urgence qu'il a utilisés pour les autoriser.
Une large vaccination peut inhiber la propagation du virus SRAS-CoV-2, ce qui empêche également ses mutations constantes de créer une variante plus infectieuse ou qui provoque une maladie plus grave.
Cependant, la vaccination au Minnesota n'offre qu'une protection partielle contre les variantes, qui peuvent augmenter dans d'autres États ou pays. Les responsables de la santé ont identifié cette semaine six infections du Minnesota impliquant une variante de l'Inde - bien qu'il reste difficile de savoir s'il s'agit d'une «variante préoccupante» qui présente plus de menace que d'autres.
Le séquençage des signatures génétiques uniques d'échantillons viraux restera un outil de surveillance important - en particulier pour l'arrivée au Minnesota de toutes les variantes présentant une résistance aux vaccins.
La technologie a également été utilisée pour suivre la lignée géographique ou la propagation du SRAS-CoV-2 et pour relier les chaînes de transmission entre elles. Les responsables de la santé du Minnesota, par exemple, ont suivi comment un participant infecté du Sturgis Mort Motorcycle Rally dans le Dakota du Sud a ramené le virus au Minnesota l'été dernier et l'a propagé.
«Nous effectuons maintenant un séquençage à des fins cliniques, mais aussi uniquement à des fins de surveillance, afin que nous puissions garder un œil sur ce qui circule dans nos communautés», a déclaré le Dr Bobbi Pritt, responsable de la microbiologie à la Mayo Clinic de Rochester. qui contribue à la surveillance au Minnesota.
Le laboratoire de santé publique du Minnesota et plusieurs laboratoires partenaires privés et publics ont augmenté le séquençage de 300 échantillons par semaine plus tôt cette année à plus de 2500. L'identification de B.1.1.7 dans l'épidémie de Carver a été ralentie par l'analyse des échantillons prélevés trois à quatre semaines plus tôt. Maintenant, l'échantillonnage se fait à un rythme en temps réel, a déclaré Ehresmann.
Les échantillons pour le séquençage sont sélectionnés au hasard, mais aussi à partir de cas liés à des flambées plus larges dans les écoles, les restaurants, les lieux de travail ou d'autres lieux de groupe.
Mayo lance également une étude sur 22 000 échantillons du sud-est du Minnesota pour tracer le cours de la propagation virale et le type de variantes impliquées dans cette région.
Les données comparatives de 25 États publiées par les Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis ont montré que le Minnesota a séquencé 6064 échantillons au cours d'une période de quatre semaines se terminant le 10 avril - le nombre le plus élevé derrière la Floride et la Californie. Le CDC a également constaté que le Minnesota au cours de cette période avait l'un des taux les plus élevés, à 67,5%, d'échantillons contenant la variante B.1.1.7.
Les responsables de la santé de l'État ont déclaré que cela ne signifiait pas nécessairement que le Minnesota avait plus d'un problème B.1.1.7 que d'autres États - seulement qu'il le recherchait de manière plus agressive.
"Vous savez comment il y a toujours des nouvelles sur la façon dont le Minnesota a le plus d'épidémies d'origine alimentaire dans le pays ou le plus dans le Midwest - nous avons l'air d'avoir de terribles restaurants", a déclaré Stephanie Meyer, responsable de l'épidémiologie et des données pour le Minnesota. Section COVID-19 du ministère de la Santé. «Ce que nous avons vraiment, ce sont des systèmes bien réglés qui peuvent trouver des choses que d’autres n’ont pas.… Je crois [the B.1.1.7 rate] être assez représentatif de ce que les autres États verraient s'ils avaient la capacité de faire ce que nous faisons. "
Il n'y a guère de doute, cependant, que la dernière vague provoquée par B.1.1.7 a été plus sévère dans le Minnesota. Le rapport d'état COVID-19 le plus récent de la Maison Blanche a montré que le Minnesota avait toujours le troisième taux le plus élevé de nouvelles infections pour la semaine se terminant le 29 avril.
Dix-sept décès dus au COVID-19 ont été signalés mercredi dans le Minnesota, ainsi que 1 267 infections supplémentaires, portant le total de la pandémie de l'État à 7 191 décès et 582 576 infections diagnostiquées. Les décès rapportés mercredi comprenaient un résident du comté de Ramsey âgé de 25 à 29 ans - seul le 14e décès par COVID-19 d'une personne de moins de 30 ans dans le Minnesota.
Les décès n'ont pas augmenté dans la dernière vague au même rythme que les infections et les hospitalisations, et les responsables de la santé pensent que cela est dû à une large vaccination chez les personnes âgées et autres personnes à haut risque.
Quatorze des 17 décès COVID-19 impliquaient des personnes qui vivaient dans des résidences privées. À la fin de 2020, les résidents des établissements de soins de longue durée représentaient 64% du total des décès dus au COVID-19 au Minnesota. Après leur avoir donné la priorité aux fournitures initiales de vaccins, la proportion de décès dus au COVID-19 impliquant des résidents de soins de longue durée en 2021 est tombée à 51%.
Près de 2,6 millions de personnes dans le Minnesota ont au moins reçu une première dose de vaccin, et Walz a célébré mercredi que plus de 2 millions de personnes ont terminé la série à une ou deux doses.
«Chaque Minnesotan qui reçoit une balle dans le bras nous rapproche de la clôture de ce chapitre», a déclaré le gouverneur, «et du retour à toutes les choses que nous aimons dans la vie.
Jeremy Olson - 612 673-7744
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