Alors que de nombreux Texans du Nord sont revenus à leur mode de vie d'avant la pandémie alors que les vaccinations contre le COVID-19 se poursuivent, des variantes du virus circulent toujours et constituent un danger pour les personnes qui ne sont pas encore protégées.
Les variantes de tout virus sont courantes et attendues – mais les mutations du virus qui causent le COVID-19 sont particulièrement inquiétantes pour les experts de la santé en raison du danger qu'elles peuvent représenter pour les personnes non vaccinées.
Les communautés du nord du Texas et de tout le pays se battent contre les souches mutantes pour obtenir autant de vaccins dans autant de bras que possible afin que de nouvelles versions potentiellement plus contagieuses et sévères du virus puissent être anéanties.
Mais comment savoir si vous êtes infecté par une variante du virus ? Voici ce que vous devez savoir.
Quelles variantes circulent dans le comté de Dallas ?
Les Centers for Disease Control and Prevention ont identifié quatre variantes préoccupantes du virus qui cause le COVID-19 : B.1.1.7, également connu sous le nom d'Alpha, qui a été détecté pour la première fois au Royaume-Uni ; B.1.351, également connu sous le nom de Beta, qui a été détecté pour la première fois en Afrique du Sud ; P.1, également connu sous le nom de Gamma, qui a été détecté pour la première fois chez des voyageurs en provenance du Brésil ; et B.1.617.2, également connu sous le nom de Delta, qui a été détecté pour la première fois en Inde.
Une variante préoccupante est classée par le CDC comme toute mutation du virus pour laquelle il existe des preuves d'une transmissibilité accrue, d'une maladie plus grave ou d'une réduction de l'efficacité des traitements, des vaccins ou des tests de diagnostic.
La variante Delta, qui semble se propager encore plus rapidement que la variante Alpha, en particulier chez les jeunes, est particulièrement préoccupante ces dernières semaines et peut provoquer des maladies plus graves, selon les experts de la santé.
Au 2 juillet, 166 cas de variantes de COVID-19 avaient été confirmés parmi les résidents du comté de Dallas : 131 cas de variante Alpha, deux cas de variante Beta, neuf cas de variante Delta et 15 cas de variante Gamma.
Neuf cas d'une autre variante détectée pour la première fois en Californie, connue sous le nom de B.1.429 ou Epsilon, ont également été confirmés dans le comté.
La variante Epsilon est classée par le CDC comme une variante d'intérêt, ce qui signifie qu'elle a des caractéristiques génétiques qui peuvent avoir les mêmes impacts que les variantes préoccupantes. Les variantes d'intérêt peuvent également avoir une prévalence ou une croissance plus faible dans les communautés.
Comment les responsables de la santé savent-ils qui a une variante ?
Bien que les responsables de la santé du comté donnent des mises à jour régulières sur le nombre de variantes confirmées parmi les résidents, les experts locaux de la santé disent que ce n'est pas une image complète.
"Ce n'est en aucun cas exhaustif", a déclaré le Dr Philip Huang, directeur du département de la santé du comté, faisant référence à la mise à jour quotidienne du nombre de variantes du comté. « Le message est que cela confirme simplement que [a variant] est présente et circule dans notre communauté.
Une partie du total provient de tests positifs effectués par le comté de Dallas qui sont envoyés au département de la santé de l'État pour analyse, a déclaré Huang. Il a déclaré que le comté envoyait au moins la moitié de tous ses échantillons positifs à l'État.
L'autre partie du total provient de l'analyse des tests effectués par des chercheurs de l'UT Southwestern Medical Center.
Les femmes font la queue pour se faire tester pour le COVID-19 à New Delhi, en Inde, le vendredi 2 juillet 2021. La variante Delta du virus a particulièrement préoccupé les responsables de la santé ces dernières semaines ailleurs, car elle peut se propager plus rapidement que la variante Alpha, en particulier chez les jeunes enfants, et peut provoquer une maladie plus grave. (Manish Swarup)Le Dr Jeffrey SoRelle, instructeur adjoint au département de pathologie, co-dirige cet effort. Lui et une équipe d'environ 10 autres chercheurs analysent les tests COVID-19 de l'hôpital universitaire, des cliniques et des sites de test au volant.
La première étape du processus consiste à effectuer tous les tests COVID-19 positifs et à identifier ceux qui ont une charge virale suffisamment élevée pour qu'ils soient séquencés ou analysés.
La quantité de charge virale dans un test COVID-19 dépend presque entièrement du moment où une personne est testée pour la maladie, a déclaré SoRelle. La charge virale est généralement plus élevée lorsqu'une personne tombe malade au début, puis diminue progressivement après environ deux semaines.
« Il est vrai qu'il s'agit d'une petite proportion du nombre total de tests effectués », a-t-il déclaré. "Mais en général, les tendances ont assez bien suivi avec ce que nous voyons avec les chiffres à l'échelle de l'État, ce qui nous donne au moins une certaine confiance qu'il existe des tendances similaires. Lorsque la variante UK Alpha est apparue pour la première fois, nous l'avons vue à des niveaux similaires dans notre institution à ceux signalés dans d'autres régions du Texas. »
Une fois que les chercheurs déterminent qu'il y a suffisamment de charge virale dans un test pour le séquençage, deux processus sont effectués. Le premier processus, appelé PCR ciblé, donne à l'équipe une idée plus générale de la composition du virus.
«Nous recherchons environ huit mutations différentes qui pourraient être présentes dans certaines des différentes variantes préoccupantes. C'est une sorte d'instantané, de petite image, mais peut être assez sensible », a déclaré SoRelle.
Le deuxième processus, connu sous le nom de séquençage du génome entier, donne aux chercheurs un aperçu approfondi de la constitution génétique du virus.
"Base par base ou nucléotide par nucléotide, nous voyons s'il y a des changements différents de la souche d'origine", a déclaré SoRelle. "Dans de nombreux cas, il existe de nombreuses mutations aléatoires, mais dans les variantes préoccupantes, il existe généralement de nombreuses mutations spécifiques qui peuvent être reconnues."
Un algorithme est ensuite utilisé pour déterminer si le virus est l'une des variantes.
L'ensemble du processus peut prendre jusqu'à deux semaines, a-t-il déclaré.
"Notre objectif est de voir s'il existe des variantes dans notre population, puis de voir s'il existe de nouvelles variantes que personne n'a jamais vues auparavant", a déclaré SoRelle, ajoutant que l'équipe avait identifié toutes les variantes préoccupantes du CDC parmi les tests UTSW..
Il a déclaré que l'université discutait avec le département de la santé de l'État de la possibilité de séquencer les tests COVID-19 à plus grande échelle auprès d'autres fournisseurs.
Il a également soumis une proposition de subvention pour commencer à analyser les informations démographiques sur les personnes testées positives pour les variantes de COVID-19.
«C'est un défi. Cela aidera lorsque nous pourrons obtenir plus de spécimens de différentes zones pour obtenir une meilleure image », a déclaré SoRelle. « Nous avons une idée générale de ce qui se passe, mais vous avez besoin d'une loupe plus grande. »
Les individus ont-ils besoin de savoir s'ils sont malades avec une variante ?
L'équipe de SoRelle informe le service de santé publique de tout variant positif détecté. Mais ni l'UTSW ni le service de santé du comté n'informent les individus s'ils sont positifs pour une variante.
Bien que la façon dont les tests sont analysés ne soit pas unique au virus COVID-19, l'équipe n'informe pas les individus car le type de test est utilisé uniquement à des fins de recherche. Il a dit qu'il n'y a pas de tests approuvés pour donner aux patients des informations sur les variantes.
Les experts de la santé disent qu'à un niveau individuel, peu importe que les gens sachent qu'ils ont été testés positifs pour les variantes ou non, car les conseils sont toujours les mêmes, quelle que soit la mutation que quelqu'un peut avoir.
"Il n'y a pas de différence. Nous n'avons pas de traitement particulier basé sur votre variante, nous n'avons pas de protocole particulier basé sur votre variante », a déclaré le Dr Marcial Oquendo, pédiatre et membre de la Dallas County Medical Society. "En fin de compte, les recommandations pour vous en tant que personne infectée, cela ne change pas selon que c'est l'un ou l'autre."
Mais les épidémiologistes et autres experts de la santé doivent connaître les variantes d'une communauté afin de mieux déterminer le niveau de risque d'une communauté en fonction de la façon dont le virus se propage.
Emilia Carreno, 16 ans, a reçu un vaccin contre le COVID-19 de Kendall Payne lors d'une clinique pop-up organisée par Dallas ISD et Parkland Memorial Hospital au Samuell High School le 28 juin. Les responsables de la santé affirment que les personnes qui ne sont pas vaccinées pour COVID-19 est particulièrement à risque de contracter l'une des variantes émergentes de la maladie. (Jason Janik / Contributeur spécial)Les experts de la santé craignent que si les taux de vaccination ralentissent, les variantes auront des effets néfastes sur les personnes qui n'ont pas été vaccinées.
"Maintenant que nous avons quelque peu atteint un plateau ou atteint ce petit creux chez les personnes qui se font vacciner, c'est notre préoccupation", a déclaré le Dr Mark Casanova, ancien président de la Dallas County Medical Society. « Il y a suffisamment de bois sec dans le tas pour que cette prochaine vague ait assez de combustible pour allumer un autre feu. Maintenant, sera-ce un brasier qui fait rage, comme l'été dernier, l'hiver dernier ? Non, mais ça va être un incendie quand même.
À ce stade de la pandémie, les experts de la santé affirment que les conséquences graves de la maladie, comme l'hospitalisation et le décès, sont évitables au niveau individuel. Le fait que davantage de variantes transmissibles du COVID-19 circulent devrait motiver les gens à se faire vacciner.
"Il est plus important que l'individu sache que" Hé, écoutez, ce n'est pas le COVID de 2020. C'est le COVID de 2021 "", a déclaré Casanova. "Il est important d'être conscient que non seulement il est plus transmissible, il y a donc une plus grande probabilité que vous puissiez l'acquérir, mais il semble provoquer des infections plus graves et plus importantes."
