Les scientifiques ont identifié une nouvelle variante de COVID-19 en Afrique du Sud et ont déclaré dans un article récemment pré-imprimé qu'il affiche "des constellations de mutations".
Il n'y a qu'une centaine de cas documentés de la variante C.1.2, identifiés pour la première fois en mai, en Afrique du Sud, selon la KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), qui a séquencé et suivi des variantes pendant la pandémie.
Dans l'article, qui est pré-imprimé et n'a pas encore été évalué par des pairs, les chercheurs de KRISP ont décrit les différentes mutations qui pourraient un jour créer C.1.2. une variante de préoccupation à travers le monde. Les Centers for Disease Control and Prevention ont une «alerte désignée pour une surveillance plus poussée» sur la variante, à partir de mercredi, mais elle n'a pas encore été répertoriée comme variante préoccupante ou intéressante.
Le Dr Richard Lessells, spécialiste des maladies infectieuses et co-auteur de l'article, a déclaré qu'il soupçonnait, par extrapolation, que C.1.2 ne représente que 1% à 2% des cas en Afrique du Sud, mais il y a lieu de soupçonner que il pourrait devenir une variante dominante, comme le delta. Il a déjà été identifié dans huit des neuf provinces sud-africaines.
"Je pense que sur la base de ce modèle de mutation, ce qui nous inquiète, c'est cette combinaison d'évasion immunitaire significative et de transmissibilité améliorée", a déclaré Lessells à propos de C.1.2. « Nous ne savons tout simplement pas comment cela se passe, si cela peut avoir augmenté la transmissibilité à un niveau similaire à delta ou non ; nous ne le savons qu'en voyant comment cela se joue dans la population.
Lessells a déclaré qu'il n'était pas encore nécessaire de déclencher des alarmes importantes. Il a noté qu'il est "tout à fait plausible" que la variante "s'éteigne" et n'atteigne jamais le niveau de devenir une variante préoccupante.
"Mais il est également plausible que nous puissions commencer à voir une augmentation des cas", a-t-il déclaré. "C'est très difficile à prévoir, et malheureusement, nous devons attendre de voir comment cela se déroulera."
Bien qu'il n'y ait jusqu'à présent que 100 cas signalés, ce nombre peut être trompeur, a déclaré Lessells, car il ne représente que les échantillons obtenus par le laboratoire. Il est probable qu'il existe de nombreux cas qui n'ont pas encore été documentés ou séquencés.
"Mais nous avons vu que la distribution peut changer assez rapidement", a déclaré Lessells. "C'est là où nous en sommes pour le moment, en surveillant activement cela pour voir si la distribution commence à changer dans les prochaines semaines."
Dans de nombreux cas, les scientifiques ont vu des variantes devenir la souche dominante de COVID-19 en quelques semaines, a déclaré Lessells. Ce fut le cas pour la variante bêta, qui est apparue pour la première fois en Afrique du Sud, ainsi que pour la variante delta hautement transmissible identifiée pour la première fois en Inde, il est donc important que les scientifiques continuent de surveiller la propagation et l'évolution de la variante.
Ce qui est particulièrement intrigant à propos de C.1.2, c'est qu'il a peut-être évolué chez des individus immunodéprimés porteurs d'une souche antérieure du virus dans un processus appelé « évolution intra-hôte accélérée », a déclaré Lessells.
Au cours de l'évolution intra-hôte, les personnes immunodéprimées "et incapables d'éliminer le virus à court terme peuvent avoir une infection chronique plus prolongée", de sorte que le virus évolue à l'intérieur du corps en raison de la pression accrue du système immunitaire, a déclaré Lessells..
"Vous obtenez donc ces variantes qui, si elles se propagent, ont un avantage évolutif et peuvent commencer à se propager plus largement", a-t-il ajouté.
Lessells a souligné que la recherche jusqu'à présent sur C.1.2 est "très préliminaire", mais ses nombreuses mutations font qu'il est probable qu'il échappera à l'immunité, que ce soit du vaccin ou d'une infection antérieure. D'autres études seront nécessaires pour déterminer si cette hypothèse deviendra une réalité.
