La souche Delta serait responsable de la deuxième vague mortelle d'infections
L'Inde a classé une nouvelle variante du coronavirus identifiée pour la première fois en Europe comme une "variante préoccupante", mais il est trop tôt pour vraiment le dire.
Une mutation est élevée d'une "variante d'intérêt" à une "variante préoccupante" (VOC) lorsqu'elle montre qu'elle remplit au moins un critère parmi plusieurs, notamment une transmission facile, une maladie plus grave, une neutralisation réduite par les anticorps ou une efficacité réduite de traitement et vaccins.
Le ministère indien de la Santé affirme que des études ont montré que la variante dite Delta Plus - également connue sous le nom d'AY.1 - se propage plus facilement, se lie plus facilement aux cellules pulmonaires et est potentiellement résistante à la thérapie par anticorps monoclonaux, une puissante perfusion intraveineuse d'anticorps pour neutraliser le virus.
La variante est liée au delta, une variante existante préoccupante, qui a été identifiée pour la première fois en Inde l'année dernière et qui aurait entraîné la deuxième vague mortelle d'infections en été.
Le ministère de la Santé a déclaré que la variante Delta Plus, découverte pour la première fois en Inde en avril, a été détectée dans environ 40 échantillons de six districts de trois États - Maharashtra, Kerala et Madhya Pradesh. Au moins 16 de ces échantillons ont été trouvés dans le Maharashtra, l'un des États les plus durement touchés par la pandémie.
Delta Plus a également été trouvé dans neuf autres pays - États-Unis, Royaume-Uni, Portugal, Suisse, Japon, Pologne, Népal, Russie et Chine - par rapport à la souche Delta originale hautement contagieuse, qui s'est maintenant propagée dans 80 pays.
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Les virus mutent tout le temps et la plupart des changements sont sans conséquence. Certains nuisent même au virus. Mais d'autres peuvent rendre la maladie plus infectieuse ou menaçante - et ces mutations ont tendance à dominer.
Mais d'éminents virologues ont remis en question l'étiquetage de Delta Plus en tant que variante préoccupante, affirmant qu'il n'y avait pas encore de données prouvant que la variante était plus infectieuse ou entraînait une maladie plus grave par rapport aux autres variantes.
"Il n'y a pas encore de données pour étayer la variante préoccupante", a déclaré le Dr Gagandeep Kang, virologue et première femme indienne à être élue membre de la Royal Society de Londres.
L'histoire continue
"Vous avez besoin d'informations biologiques et cliniques pour déterminer s'il s'agit vraiment d'une variante préoccupante."
Cela signifie que l'Inde a besoin de plus de données pour déterminer si la variante est neutralisée par des anticorps générés par les vaccins disponibles ou une infection par une autre variante du coronavirus.
En outre, des données détaillées sont nécessaires sur l'augmentation de la transmissibilité, les échecs de diagnostic - les tests de routine ne détectent pas le variant - et si le variant provoque une maladie plus grave.
Des centaines de milliers de génomes viraux ont été analysés à travers le monde
"Vous devez étudier quelques centaines de patients atteints de cette maladie et de cette variante et découvrir s'ils courent un plus grand risque de maladie plus grave que la variante ancestrale", a déclaré le Dr Kang.
La variante Delta plus contient une mutation supplémentaire appelée K417N sur le pic de coronavirus, qui a été trouvée dans les variantes bêta et gamma, trouvées pour la première fois en Afrique du Sud et au Brésil respectivement (la bêta était liée à une augmentation des hospitalisations et des décès lors de la première vague d'infections en Afrique du Sud, tandis que Gamma a été estimé comme hautement transmissible).
Même avec 166 exemples de Delta Plus partagés sur GISAID, une base de données mondiale ouverte de partage, "nous n'avons pas beaucoup de raisons de croire que c'est plus dangereux que le Delta d'origine", selon le Dr Jeremy Kamil, virologue à la Louisiana State University. Centre des sciences de la santé à Shreveport.
"Delta Plus pourrait avoir un léger avantage pour infecter et se propager entre des personnes qui ont déjà été infectées plus tôt pendant la pandémie ou qui ont une immunité vaccinale faible ou incomplète", m'a dit le Dr Kamil.
"Je garderais mon calme. Je ne pense pas que l'Inde ou quiconque dans le monde ait publié ou accumulé suffisamment de données pour distinguer le risque du soi-disant Delta Plus comme étant plus dangereux ou préoccupant que la variante Delta d'origine."
Le Dr Anurag Agarwal, directeur du CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology (IGIB), basé à Delhi, l'un des 28 laboratoires indiens impliqués dans le séquençage du génome, a déclaré que « toutes les lignées de la variante Delta sont des variantes préoccupantes », il y avait donc rien d'inhabituel à étiqueter Delta Plus en tant que tel.
"Nous n'avons pour l'instant aucun indicateur montrant que Delta Plus devrait provoquer des inquiétudes ou une panique en matière de santé publique. Nous ne voyons rien d'inquiétant pour le moment. Nous le suivons attentivement et renforçons toutes les mesures de santé publique", a-t-il déclaré.
Le Dr Kamil a déclaré que le gouvernement indien "préférerait réagir de manière excessive maintenant que de paraître indifférent plus tard, comme ce fut le cas avec la variante Delta".
La plupart des scientifiques disent que l'Inde a laissé tomber le séquençage d'un nombre suffisant d'échantillons pour la variante qui avait alimenté une deuxième vague massive d'infections à Covid en Inde en avril et mai.
"Je ne suis pas trop inquiet. Mais il est juste de garder un œil sur la variante."
