Le Royaume-Uni a aujourd'hui (dimanche 27 juin) dépassé plus d'un demi-million de tests de coronavirus positifs séquencés génomiquement (COVID-19), alors que le programme de tests du Royaume-Uni continue de s'intensifier.

La force de la base britannique de la science génomique et de l'industrie du séquençage des diagnostics a permis au Royaume-Uni d'identifier rapidement les variantes de COVID-19 et de capturer des données critiques qui ont permis de suivre et de garder une longueur d'avance sur les mutations du génome du virus. On estime que le Royaume-Uni contribue à environ 50 % de tous les séquençages partagés à des fins de comparaison dans le monde.

Le Royaume-Uni dépasse les 500 000 tests de coronavirus (COVID-19) séquencés génomiquement

Le séquençage génomique est une analyse en laboratoire qui identifie la constitution génétique d'un virus, permettant de détecter de nouvelles variantes ou mutations dans des variantes existantes. L'atteinte de ce jalon témoigne de l'extraordinaire expertise du Royaume-Uni en génomique et des efforts des chercheurs, des scientifiques et analystes de laboratoire, des cliniciens et des décideurs.

Grâce à la capacité mondiale de séquençage génomique du Royaume-Uni, les cas de la variante Delta (B1.617.2) ont été rapidement détectés, ainsi que d'autres variantes préoccupantes. Cela a permis au gouvernement de déployer rapidement un soutien supplémentaire dans les domaines où des variantes préoccupantes étaient répandues, telles que les tests de surtension et la recherche améliorée des contacts, pour aider à ralentir la propagation des variantes en brisant les chaînes de transmission.

Le ministre de l'Innovation, Lord Bethell, a déclaré :

De Fred Sanger à nos jours, le Royaume-Uni a une fière tradition de développement de technologies génétiques et génomiques qui améliorent la vie des patients à travers le pays et dans le monde.

Cette étape importante témoigne du travail acharné, du dévouement et du génie des chercheurs et des scientifiques des laboratoires de tout le pays, ainsi que de ceux qui sont en première ligne de notre bataille contre ce virus misérable.

Il est vital que nous non seulement maintenions, mais développions notre leadership mondial en génomique et que nous fassions tout notre possible pour libérer son énorme potentiel.

Le public britannique a joué son rôle à chaque étape de cette pandémie et j'exhorte tout le monde à faire sa part en se faisant tester lorsqu'on lui a demandé de le faire, afin que nous puissions continuer à détecter de nouvelles variantes préoccupantes et à nous protéger nous-mêmes et nos communautés à mesure que les restrictions s'assouplissent..

Des tests de surtension ont été déployés dans des zones spécifiques à travers le pays pour surveiller et supprimer la propagation de COVID-19 et pour mieux comprendre les nouvelles variantes. Le séquençage génomique est un élément clé des tests de pointe car il permet aux scientifiques de continuer à identifier les variantes préoccupantes, ainsi que tout changement apporté aux variantes connues ou d'identifier de nouvelles variantes émergentes qui doivent être suivies. Tous les tests positifs avec une charge virale suffisamment élevée dans les codes postaux des tests de surtension et des sites de test identifiés seront envoyés pour séquençage.

En plus des tests de surtension, le gouvernement fournit des packages de soutien supplémentaires pour arrêter la propagation de la variante Delta, qui comprend un soutien pour ceux qui s'auto-isolent et une activité pour maximiser la vaccination dans la région. Cela a été rapidement déployé dans des régions telles que Bedford, le Grand Manchester, le Lancashire, le Cheshire et Birmingham.

Pour augmenter notre préparation et renforcer nos défenses contre les nouvelles variantes, nous avons soutenu une nouvelle technologie de détection des variantes connues, connue sous le nom de « test de test de génotype », qui détecte les mutations qui indiquent des variantes connues préoccupantes en aussi peu que 48 heures après un COVID- positif. 19 Résultat du test PCR. Les tests de dosage du génotype doivent être utilisés après la PCR, et afin de détecter le nombre maximal de cas avec des variantes, le gouvernement utilise des tests PCR de confirmation pour les résultats positifs des tests LFD en Angleterre pendant les périodes de faible prévalence. Des tests de confirmation sont utilisés pour valider le résultat du test rapide LFD initial.

Le virus continuera d'évoluer naturellement au fur et à mesure qu'il se propage dans le monde, mais le Royaume-Uni continuera d'utiliser ses excellentes capacités en génomique, épidémiologie et virologie pour surveiller toutes les variantes afin de garantir que les interventions de santé publique sont efficaces et proportionnées.

La directrice générale de l'UKHSA, Jenny Harries, a déclaré :

Le séquençage des génomes a été l'un des outils les plus polyvalents de notre arsenal dans la bataille contre COVID-19, et à mesure que nous progressons dans la feuille de route, son rôle ne fait qu'augmenter – nous aidant à suivre les mutations du virus et à agir de manière décisive pour empêcher les cas de devenir des épidémies.

Le Royaume-Uni a partagé ses capacités génomiques exceptionnelles avec le monde pendant cette pandémie mondiale et notre expertise dans ce domaine sera au cœur de notre mission à la UK Health Security Agency.

Chaque génome séquencé nous aide à déjouer les virus en armant le gouvernement et nos scientifiques de données fiables et je suis extrêmement reconnaissant à tous ceux qui ont travaillé si dur pour nous permettre d'atteindre cette étape fantastique.

Processus de séquençage du génome

Le séquençage génomique a été essentiel pour détecter et répondre aux souches émergentes de COVID-19 et aux variantes préoccupantes. Public Health England (PHE) a surveillé de près l'évolution du COVID-19 au fil du temps avec de nouvelles variantes, améliorant la compréhension de la façon dont ces changements affectent les caractéristiques du virus et utilisant ces informations pour évaluer la transmissibilité accrue de nouvelles souches.

Au début de la pandémie, le consortium COVID-19 Genomics UK (COG-UK) a été créé pour fournir un séquençage rapide et à grande échelle du virus du génome entier aux centres locaux du NHS et au gouvernement. Les données collectées par le consortium ont aidé les agences de santé publique à mieux gérer l'épidémie au Royaume-Uni et à éclairer les efforts de développement de vaccins. Le séquençage est maintenant assuré par le biais d'un programme au sein de l'UKHSA s'appuyant sur les travaux du COG-UK.

Après le séquençage, les données du génome du virus sont combinées à des ensembles de données cliniques et épidémiologiques afin d'aider à orienter les interventions et les politiques de santé publique au Royaume-Uni. À l'avenir, ces informations permettront d'évaluer de nouveaux traitements et interventions non pharmacologiques et fourniront des informations sur la transmission communautaire et les épidémies. Ces données permettront également aux chercheurs d'identifier et d'évaluer les changements génétiques émergents dans les variantes connues et d'examiner comment ils affectent la capacité du virus à se transmettre d'une personne à l'autre.

Une partie essentielle de notre surveillance génomique consiste à soutenir la sécurité mondiale en testant les personnes voyageant à l'étranger. Les scientifiques de PHE téléchargent des informations sur les séquences de variantes au GISAID, alertant les autres pays de la présence de variantes dans différentes régions du monde.

Le programme d'évaluation des nouvelles variantes du Royaume-Uni soutient déjà les pays qui utilisent la technologie de séquençage génomique du Royaume-Uni pour détecter de nouvelles variantes, en leur fournissant un soutien technique et en formant leurs scientifiques.

Leadership britannique en génomique

La recherche britannique a conduit à des découvertes de changement de paradigme en génétique - de la découverte originale de la structure de l'ADN à notre implication dans le projet du génome humain.

Le Royaume-Uni a également ouvert la voie en traduisant la recherche fondamentale en pratique clinique et en améliorant les résultats pour les patients. Il abrite également une vaste infrastructure de recherche en génomique et en santé, de la UK Biobank, établie en 2006 à Genomics England, au NHS England et à l'Amélioration Genomic Medicine Service (GMS).

La génomique n'est qu'un exemple de l'engagement de ce gouvernement à faire avancer l'innovation dans les soins de santé au Royaume-Uni, qui jouera un rôle central dans sa future résilience en matière de santé, la croissance de son secteur des sciences de la vie et les mesures visant à améliorer les soins aux patients.

Informations d'arrière-plan

Une liste à jour des zones où les tests de surtension sont actuellement déployés est disponible.