Un écouvillon est administré pour les tests COVID-19 sur un site de test au volant du comté de Callaway le 17 novembre 2020. (photo avec l'aimable autorisation du bureau du gouverneur du Missouri)

En juin, alors que la variante Delta de COVID-19 s'installait dans le Missouri, la moyenne sur sept jours des nouveaux cas a doublé.

La propagation de la variante delta signifie que les cas COVID du Missouri peuvent «doubler ou tripler» en juillet • Missouri Independent

Et maintenant que la mutation facilement propagée a atteint tous les coins de l'État, juillet sera une répétition de juin, ou pire, selon le professeur de l'Université du Missouri surveillant les eaux usées pour le coronavirus.

"Presque partout où nous avons vu apparaître la variante Delta, nous avons vu un pic de cas en deux ou trois semaines", a déclaré jeudi Marc Johnson, professeur de microbiologie moléculaire et d'immunologie.

La variante a été identifiée pour la première fois à Branson en mai et s'est depuis propagée dans tout l'État. Il a été identifié dans chacun des 36 échantillons des grands et petits réseaux d'égouts collectés entre le 14 et le 20 juin.

"Je suppose que le nombre global de cas dans l'État va doubler ou tripler au cours des prochaines semaines", a déclaré Johnson.

Le Missouri a signalé plus de 1 000 cas supplémentaires de COVID-19 mercredi et jeudi, la première fois depuis le 12 février avec des jours consécutifs de plus de 1 000 cas. La dernière date avec 3 000 cas ou plus était le 15 janvier.

La moyenne sur sept jours des cas signalés, 400 par jour le 1er juin, était de 886 par jour mercredi.

Le nombre le plus élevé signalé en une seule journée était de 6 606 le 14 novembre. Le nombre le plus bas depuis le 1er janvier, autre qu'un week-end férié, était de 189 le 24 mai.

Le Missouri a enregistré 620 025 cas de COVID-19 depuis que le premier a été identifié en mars 2020. Le ministère de la Santé et des Services aux personnes âgées (DHSS) a signalé 9 350 décès, 1,5% du total des cas confirmés par les tests.

En raison du pic de cas, l'État demande l'aide fédérale aux équipes d'intervention d'urgence nouvellement formées, a écrit la porte-parole du DHSS, Lisa Cox, dans un e-mail. Elle avait peu d'autres détails.

"Je fournirai plus autant que je le pourrai, mais je ne pense pas que nous ayons encore de dates fermes", a écrit Cox.

Le Kansas City Star a rapporté que l'équipe se concentrera sur les efforts de confiance dans les vaccins, l'épidémiologie, la surveillance et le soutien au séquençage liés à la variante Delta.

Le Missouri est le 39e des 50 États et du district de Columbia en matière de livraison de vaccins, selon les Centers for Disease Control. À l'échelle de l'État, 44,5% de la population de l'État a reçu au moins une dose de vaccin, contre 54,6% à l'échelle nationale. Une seule des 117 juridictions locales du département de la santé de l'État, le comté de Boone, dépasse les 50 %.

Il y a 34 juridictions avec moins de 25 pour cent commençant la vaccination, dont sept avec moins de 20 pour cent.

Un vaccin est le seul outil disponible qui peut arrêter la propagation, a déclaré Scott Clardy, directeur adjoint du département de la santé publique et des services sociaux du comté de Columbia-Boone.

"Ce vaccin n'est pas efficace à 100% pour vous empêcher de contracter COVID-19", a déclaré Clardy. « Mais ce à quoi il est très efficace, c’est de vous garder hors de l’hôpital et de vous empêcher de mourir de COVID-19. »

Où ça a été

Depuis janvier, le Missouri semblait être fermement à la baisse de la courbe COVID-19.

De près de 90 000 cas au début de l'année, les nouvelles infections sont tombées en dessous de 30 000 en février et en dessous de 20 000 en mars.

En mai, ils étaient moins de 15 000.

Mais à la fin du mois de mai, les premiers indices d'une nouvelle vague étaient clairs. Les comtés de Linn et Livingston, dans le nord-ouest du Missouri, ont enregistré 488 nouveaux cas combinés, soit une augmentation de 17% du nombre total d'infections.

À cette époque, l'analyse de Johnson montrait la variante Delta uniquement à Branson, Brookfield dans le comté de Linn et Licking dans le comté du Texas.

La variante s'est étendue de Branson le long des couloirs routiers menant à Springfield et au lac des Ozarks et bientôt la majeure partie du sud-ouest du Missouri montrait des pointes dans les cas. Sur 774 cas en mai, le comté de Greene a enregistré 2 524 cas de COVID-19 en juin, selon les données de l'État. Le total le plus élevé est survenu le 30 juin, avec 204 cas supplémentaires.

Le déplacement des zones rurales vers des centres plus peuplés a inversé la voie empruntée par la variante Alpha, identifiée pour la première fois en Grande-Bretagne, qui est apparue pour la première fois dans les zones plus peuplées de l'État, a déclaré Johnson.

Des études suggèrent que la variante Delta est 40 à 60 % plus transmissible que la variante Alpha, qui se propage 50 % plus facilement que le coronavirus d'origine qui a émergé en Chine en 2019.

Au moment où les échantillons ont été prélevés début juin, 18 des systèmes d'assainissement testés présentaient la variante Delta, certains en combinaison avec la variante Alpha. La carte utilisée pour illustrer les résultats des eaux usées identifie la variante avec un symbole codé par couleur.

Les données les plus récentes, publiées mardi, contiennent 19 cases violettes, de la minuscule Memphis dans le nord-est du Missouri, 1 822 habitants, au Metropolitan Sewer District desservant les maisons et les entreprises de Saint-Louis.

Où ça va

Cette carte, une capture d'écran d'un site Web géré par le ministère de la Santé et des Services aux personnes âgées, montre les cases violettes où la variante Delta est dominante dans les eaux usées.

Maintenant que la variante Delta est établie dans tout l'État, il y a beaucoup d'incertitude, a déclaré Johnson.

"Tous les grands endroits qu'il a touchés ont eu le même schéma", a-t-il déclaré. "Je ne sais pas à quoi cela ressemblera parce que le seul endroit qui est arrivé à la fin est Brookfield et ils ont peut-être manqué de personnes à infecter."

Il y a 11 920 personnes dans le comté de Linn et 13,4% ont eu des infections au COVID-19 identifiées par un test.

L'augmentation des nouveaux cas est claire dans les comtés de Boone et de Buchanan, qui comptaient chacun plus de 425 cas en juin et plus de 200 au cours de la dernière semaine du mois.

Les écoles publiques de Columbia dans le comté de Boone comptent 384 étudiants et 13 professeurs et membres du personnel à la maison avec un cas positif de COVID-19 ou en quarantaine en raison de l'exposition de la session d'été qui a commencé le 14 juin. Le district compte 8 900 étudiants inscrits à des cours d'été, le Columbia Missourian signalé.

Tous les indicateurs du comté de Boone montrent qu'une augmentation rapide des cas est probable. Le taux de positifs pour les tests COVID-19 effectués par les trois systèmes hospitaliers de Columbia, inférieur à 3% au cours des premières semaines de mai, est de 13,3% au cours de la période de sept jours se terminant jeudi.

D'une moyenne de sept jours de 4 cas par jour le 31 mai, le taux était de 36 par jour jeudi. Le 19 avril, seules cinq personnes, dont quatre du comté de Boone, ont été hospitalisées avec COVID-19. Jeudi, ils étaient 53, tous sauf 5 de la région rurale d'environ 25 comtés desservis par les hôpitaux de la ville.

Le service de santé a déplacé son statut d'hôpital en jaune, ce qui signifie que des mesures ont été prises soit pour retarder les transferts depuis d'autres établissements, soit pour réduire d'autres opérations afin de se concentrer sur les patients COVID-19.

"J'espère que les choses ne vont pas aussi mal qu'elles ne l'étaient en novembre, lorsque personne n'avait été vacciné", a déclaré Clardy.

Le département recueille les données qui montreront combien de personnes hospitalisées n'ont pas été vaccinées, a déclaré M. Clardy.

"Juste n'importe quoi pour faire comprendre aux gens que c'est sérieux", a-t-il déclaré.

Les vaccins sont un outil qui n'était pas disponible lorsque le virus faisait rage à la fin de l'année dernière, a déclaré Clardy. Alors que le comté est en tête de l'État en matière de tirs administrés, a-t-il déclaré, ce n'est pas suffisant.

"Nous avons la capacité d'empêcher que cela n'augmente maintenant", a déclaré Clardy. « Nous avons des vaccins. Nous avons toujours des choses comme le masquage, la distanciation sociale et rester à la maison, mais nous devons continuer à faire pression pour faire vacciner autant de personnes que possible. »

Le département n'envisage pas de recommandations contre les rassemblements pour le jour de l'indépendance et la ville a prévu une célébration complète au centre-ville pour son bicentenaire.

Le projet de Johnson est une collaboration entre l'université, le ministère des Ressources naturelles, qui réglemente les eaux usées et collecte les échantillons, et le ministère de la Santé de l'État, qui communique les données aux services de santé locaux.

Jeff Wenzel, chef du Bureau d'épidémiologie environnementale du département de la santé de l'État, a déclaré que le lien entre les résultats de l'échantillonnage des eaux usées et l'apparition de nouveaux cas est très fort.

"Avec notre outil, lorsque nous avons constaté une augmentation de la charge virale de 40% ou plus en une semaine, elle est suivie d'une augmentation de 25% des cas, au moins", a déclaré Wenzel.

Un aspect de la propagation du coronavirus qui était évident dès le début est que les personnes qui ne présentent pas de symptômes peuvent infecter les autres.

« Nous n’avons pas encore fini de lutter contre COVID », a déclaré Wenzel. « Nous continuons à voir ces variantes, Alpha, Delta. Nous devons toujours avoir une bonne hygiène et rester à la maison si vous êtes malade. Vous devez toujours vous faire vacciner si vous ne l'êtes pas déjà.

Les hospitalisations dans tout l'État ont augmenté de plus de 40% en juin, dépassant 900 le 28 juin pour la première fois depuis le 16 mars. Les hospitalisations ont culminé à 2 862 fin décembre.

La plus forte augmentation a eu lieu dans le sud-ouest du Missouri et Steve Edwards, PDG de CoxHealth à Springfield, a été franc dans son mépris pour les personnes qui doutent de l'efficacité du vaccin ou du danger de COVID-19.

32% pos. symptomatique. taux, très préoccupant ! (À partir de 4%) 4 patients pédiatriques Covid hospitalisés hier. Âge…quelques semaines à 18 ans

Si vous faites des commentaires très désobligeants sur le vaccin et que vous n'avez aucune expertise en santé publique, vous pourriez être responsable de la mort de quelqu'un. Tais-toi. pic.twitter.com/TqkNbZKsYE

Ses hôpitaux traitent 74 cas de COVID-19, dont quatre patients pédiatriques, a-t-il tweeté jeudi. Les enfants sont âgés de quelques semaines à 18 ans.

"Si vous faites des commentaires extrêmement désobligeants sur le vaccin et que vous n'avez aucune expertise en santé publique, vous pouvez être responsable de la mort de quelqu'un", a écrit Edwards. "Tais-toi."