Alors que l'effort mondial pour limiter l'impact de la pandémie s'accélère, observez comment des changements subtils de comportement social ou le niveau de contagiosité du virus peuvent affecter la bataille pour arrêter sa propagation
Cette fonctionnalité interactive a été initialement publiée en avril 2020, elle a été mise à jour le 27 août 2021 pour comparer l'infectiosité de la variante du coronavirus Delta.
Une caractéristique importante des virus et autres agents pathogènes est leur degré de contagiosité.
Ceci est mesuré de plusieurs manières. Une mesure clé est le R0, ou nombre de reproduction de base, qui indique le nombre de nouveaux cas générés par une personne infectée.
Pour un R0 de trois, nous nous attendrions à ce que chaque nouveau cas de maladie produise trois autres infections.
Ce n'est pas seulement une mesure de l'infectiosité inhérente d'une maladie. Elle dépend également d'autres facteurs, dont le taux de contact au sein d'une population et la durée de la période infectieuse. C'est une valeur dépendante de la situation, donc dans une ville le R0 peut être plus élevé et dans une autre plus bas. Il suppose également que l'ensemble de la population est sensible à la maladie.
Les premières études sur le comportement de Covid-19 à Wuhan ont estimé le R0 moyen entre 2,2 et 2,7, tandis que les épidémies à plus petite échelle comme celle qui s'est produite à bord du Diamond Princess avaient un R0 estimé à 2,2. D'autres études suggèrent que des valeurs aussi basses que 1,5 et aussi élevées que 3,8 étaient possibles.
Alors, à quoi cela ressemble-t-il et comment cela se compare-t-il à d'autres maladies?
Ici, vous pouvez voir un
petit cercle rouge représentant une personne infectée.
Avec un R0 de 2,6, l'infection initiale entraîne deux à trois autres cas.
et ces personnes transmettent l'infection à deux ou trois autres personnes
Etc. Dans le cas du virus Covid-19, chaque nouvelle phase prend en moyenne entre cinq et six jours.
Ici, nous pouvons voir comment la propagation est considérablement réduite par
isoler un seul individu.
Comment le Covid-19 se compare-t-il aux autres maladies ?
Ici, vous pouvez voir les mêmes schémas de propagation générés sur la base du R0 pour une gamme d'agents pathogènes dans diverses situations, allant de la grippe espagnole à la rougeole hautement contagieuse, pour laquelle le R0 a été estimé entre 12 et 18.
Mais le R0 n'est pas le seul chiffre important. Le nombre effectif de reproduction, R, est une valeur qui prend en compte la sensibilité de la population.
Ici, nous commençons avec une seule personne portant un
infection dans une population hypothétique de 1 000
personnes non infectées.
Avec toute valeur R supérieure à 1 et une population entièrement sensible, l'infection se propagera partout.
Mais si certaines personnes ne sont pas sensibles à l'infection - en raison de l'immunité par la vaccination, parce qu'elles ont déjà été infectées ou pour d'autres raisons biologiques - ou si la transmission est freinée du fait qu'une partie de la population est
isolé, alors la valeur R effective devient plus faible et la propagation est incomplète et ralentie.
Si le R effectif est réduit en dessous de un, la propagation peut être stoppée. Réduire le R de manière générale permettra également aux systèmes de santé de mieux faire face à l'afflux de patients.
Une autre variable est la façon dont la maladie est mortelle. Certaines maladies, comme Ebola, ont un R0 inférieur à celui d'autres maladies mais un taux de mortalité élevé. Ici le
les cercles violets indiquent un décès après que l'infection s'est propagée dans la population.
Le taux de mortalité estimé pour Covid-19 varie à nouveau en fonction du lieu et de la situation, et en particulier du niveau des tests effectués. Lors de la première épidémie en Chine, par exemple, un rapport a estimé le taux de létalité à 2,3 %. En Corée du Sud, le virus a un taux de létalité estimé à 1,2 %.
Ici, vous pouvez définir les seuils pour différentes valeurs et voir le résultat à l'aide de notre modèle simplifié. La réalité des pandémies est beaucoup plus complexe, mais cela démontre les concepts de base qui sous-tendent la propagation des maladies. Ce modèle utilise une population hypothétique de 1 000 personnes pour mieux visualiser la proportion d'infections et de décès, et suppose que chaque personne peut entrer en contact avec toutes les autres personnes de la population.
R0 :
Le nombre reproducteur de base (
R0) indique combien de nouveaux cas une personne infectée génère
Taux de mortalité :
Le taux de létalité est le pourcentage de décès causés par une maladie par rapport au nombre total de personnes atteintes de la maladie
Susceptibilité :
Dans ce modèle
La susceptibilité indique si une personne peut être infectée. Cela pourrait être dû à la vaccination ou à l'immunité acquise lors d'une infection antérieure
Taux d'isolement : 0%
Les
le taux d'isolement est le pourcentage de la population qui est isolée ou mise en quarantaine
Sur
Étude de cas:
sélectionner un scénario
Diamond Princess Wuhan Cluster coréen Rougeole Contagion Ebola
Population de 1000 personnes
Études de cas (Covid-19)
Variante delta
1
Princesse de diamant
2
Aucune intervention
3
Intervention forte
4
Autres maladies
Rougeole
5
Ebola
6
Les pandémies au cinéma
Contagion
7
Remarques
La valeur d'isolement n'est pas utilisée pour la plupart des études de cas car les données d'isolement ne sont généralement pas disponibles.
- L'étude de cas de la variante Delta est destinée à montrer un scénario hypothétique dans lequel aucune mesure d'isolement n'était en place
- L'étude de cas Diamond Princess est destinée à visualiser le résultat proportionnel des infections à Covid-19 à bord du Diamond Princess. La proportion sensible de la population à 18% sur la base d'un taux d'attaque de 18% (696 cas / 3711 passagers au total) et n'est pas indicative du vrai chiffre de sensibilité (qui pourrait être plus proche de 100%). L'isolement n'est pas utilisé car aucune donnée n'est disponible. Le taux de mortalité est fixé à 1,8% sur la base du total actuel des décès (13) sur les cas (696). Le R0 utilisé est de Zhang et al. 2020
- L'étude de cas sans intervention est un exemple qui utilise des chiffres de diverses sources pour montrer un scénario hypothétique sans mesures d'isolement. La proportion sensible de la population est fixée à 70% sur la base des commentaires ici et n'est pas indicative du véritable chiffre de sensibilité (qui pourrait être plus proche de 100%). Le taux de mortalité est fixé à 1% sur la base de diverses estimations du taux de létalité des cas en Chine (Verity et al. 2020, Wighton et al. 2020). Le R0 utilisé est de 2,7
- L'étude de cas d'intervention forte est un exemple qui utilise des chiffres de diverses sources pour montrer un scénario hypothétique avec des mesures de distanciation sociale et d'isolement couvrant 40% de la population. La proportion sensible de la population est fixée à 70% sur la base des commentaires ici et n'est pas indicative du véritable chiffre de sensibilité (qui pourrait être plus proche de 100%). Le taux de mortalité est fixé à 0,66%, inférieur au scénario de non-intervention car il suppose que les soins de santé feraient mieux face à une charge de cas réduite. Le R0 utilisé est de 2,7
- L'étude de cas sur la rougeole utilise les valeurs de Information is Beautiful et du CDC. Le R0 réel pour la rougeole peut varier considérablement selon le pays et si des études ont été réalisées avant ou après l'introduction du vaccin antirougeoleux. Les taux de létalité sont également très largement dépendants du pays et de la situation épidémique.
- L'étude de cas Ebola utilise un R0 de Taylor et al 2016, un taux de létalité de l'OMS et définit la sensibilité à 30 % sur la base d'un taux d'attaque de 30 % (la susceptibilité réelle peut différer).
- L'étude de cas Contagion utilise les valeurs mentionnées dans le film : R0 sur 4, taux de mortalité de 25 % à 30 %, et « infectera 1 personne sur 12 sur la planète » (8,333 %).
Références R0 pour d'autres maladies : Sars, grippe espagnole, varicelle.
