Crédit : Pixabay/CC0 domaine public

Les sarbecovirus ont traversé l'homme à deux reprises au cours de la dernière décennie, conduisant à l'épidémie mortelle de SRAS-CoV-1 en 2002-04 et à la pandémie actuelle de COVID-19, causée par le virus SARS-CoV-2. Une nouvelle étude de l'Université d'Oxford, publiée aujourd'hui, montre que l'ancêtre commun le plus récent de ces virus existait il y a plus de 21 000 ans, près de 30 fois plus vieux que les estimations précédentes.

Les épidémies de coronavirus ont frappé pour la première fois il y a plus de 21 000 ans

Bien qu'ils aient un taux d'évolution très rapide sur de courtes périodes, pour survivre, les virus doivent rester très adaptés à leurs hôtes, ce qui impose de sévères restrictions à leur liberté d'accumuler des mutations sans réduire leur aptitude. Cela entraîne un ralentissement de la vitesse apparente d'évolution des virus au fil du temps. La nouvelle recherche, pour la première fois, recrée avec succès les schémas de cette décroissance observée chez les virus.

"Nous avons développé une nouvelle méthode qui peut récupérer l'âge des virus sur des échelles de temps plus longues et corriger une sorte de" relativité évolutive ", où le taux d'évolution apparent dépend de l'échelle de temps de mesure. Notre estimation basée sur des données de séquence virale, datant de plus de 21 000 ans, est en concordance remarquable avec une analyse récente d'un ensemble de données génomiques humaines qui suggère une infection par un ancien coronavirus à peu près à la même époque », a déclaré Mahan Ghafari, de l'Université d'Oxford.

L'étude démontre également que, bien que les modèles évolutifs existants n'aient souvent pas réussi à mesurer la divergence entre les espèces de virus sur des périodes allant de quelques centaines à quelques milliers d'années, le cadre évolutif développé dans cette étude permettra une estimation fiable de la divergence des virus sur de vastes étendues. échelles de temps, potentiellement tout au long de l'évolution animale et végétale.

Le nouveau modèle nous permet non seulement de reconstruire l'histoire évolutive des virus liés au SRAS-CoV-2, mais également une gamme beaucoup plus large de virus à ARN et à ADN au cours de périodes plus reculées dans le passé.

Les prédictions du modèle pour le virus de l'hépatite C, une des principales causes mondiales de maladie du foie, concordent avec l'idée qu'il circule depuis près d'un demi-million d'années. Le VHC pourrait donc s'être propagé dans le monde entier en tant que partie intrinsèque de la migration "hors d'Afrique" des humains modernes il y a environ 150 000 ans.

Les différents génotypes du VHC indigènes des populations humaines d'Asie du Sud et du Sud-Est et d'Afrique centrale peuvent être apparus au cours de cette période prolongée et cette échelle de temps révisée peut résoudre l'énigme de longue date de leurs distributions mondiales.

"Avec cette nouvelle technique, nous pouvons examiner beaucoup plus largement d'autres virus; réévaluer les échelles de temps de leur évolution plus profonde et mieux comprendre les relations avec les hôtes qui sont essentielles pour comprendre leur capacité à provoquer des maladies", explique le professeur Simmonds, de l'Université d'Oxford.

Comprendre l'évolution des virus de type SRAS et COVID-19

Plus d'information :

Mahan Ghafari et al, Un modèle évolutif mécaniste explique le modèle dépendant du temps des taux de substitution dans les virus, Biologie actuelle (2021). DOI  : 10.1016/j.cub.2021.08.020

Fourni par

Université d'Oxford

Citation :

Les épidémies de coronavirus ont frappé pour la première fois il y a plus de 21 000 ans (2021, 3 septembre)

récupéré le 5 septembre 2021

de https://phys.org/news/2021-09-coronavirus-epidemics-years.html

Ce document est soumis au droit d'auteur. En dehors de toute utilisation équitable à des fins d'étude ou de recherche privée, aucune

partie peut être reproduite sans autorisation écrite. Le contenu est fourni seulement pour information.